Mükerrem Ünlüer, 1964 yılında Erzurum’da doğdu. 1987 yılında İstanbul Üniversitesi Siyasal Bilgiler Fakültesi’nden mezun oldu.
1989-1992 yılları ortasında Erzurum kaymakam adaylığı yaptı. Daha sonra sırasıyla Isparta’nın Gelendost ilçesinde, Artvin’in Yusufeli ilçesinde, Elazığ ilinin Palu ilçesinde, Sakarya’nın Ferizli ilçesinde kaymakamlık yapmıştır. İçişleri Bakanlığı İdari ve Mali İşler Daire Başkanlığı (2003-2007), Cumhurbaşkanlığı İdari ve Mali İşler Başkanlığı (2007-2012) ve İçişleri Bakanlığı Hukuk Müşavirliği (2012-2013) misyonlarını yürüttü. Bir yıl süreyle İngiltere’de eğitim aldı. 26 gün süren Japonya’da Afet idare Kursu ve İçişleri bakanlığının düzenlemiş olduğu çok sayıda Mülki Yönetim seminerlerine katılmıştır. Sakarya Üniversitesi Kamu İdaresi Kısmında lisansüstü eğitimini tamamlamıştır. Misyon yaptığı müddet içerisinde 9 adet takdirname 1 adet Teşekkür Dokümanı almış ve 1 kere de maaş mükafatı ile ödüllendirilmiştir. 2 Ağustos 2013 tarihli Bakanlar Heyeti Kararı ile Bayburt Valiliği misyonuna atanmıştır. 15 Eylül 2014 tarih ve 6780 nolu müşterek kararname ile merkez valiliğine atandı.
26 Eylül 2014 tarihinde İçişleri Bakanlığı müsteşar yardımcılığına atandı. 7 Mart 2015 -28 Ağustos 2015 tarihleri ortasında vekaleten İçişleri Bakanlığı Müsteşarlığı yapmıştır. 10 Ağustos Valiler Kararnamesi ile Kahramanmaraş Valisi olarak vazifeye başlamıştır.
Evli ve 2 çocuk babasıdır.
